藻类在植物界属于低等植物。藻类学家一般将藻类共分11个门。
其顺序如下：
蓝藻门 金藻门 黄藻门 硅藻门 甲藻门 隐藻门 裸藻门 绿藻门 轮藻门
褐藻门 红藻门
浮游藻类一般多见于前8个门，轮藻、褐藻门和红藻门主要是大型藻类。
二、蓝藻门
1、蓝藻门形态构造
单细胞或群体，无多细胞体。
无色素体，色素均匀地散在原生质内。色素成分主要为叶绿素a、β胡萝卜素、藻胆素。
同化产物是蓝藻淀粉。
营养细胞和生殖细胞都不具鞭毛。
细胞壁上含有粘质缩氨肽，这是蓝藻区别于其他藻类的特征之一。
不具真正的细胞核，只具核质而无核仁和核膜。
繁殖方法在藻类中最简单，没有有性生殖。
2．常见种类：
⑴色球藻属：细胞球形、半球形。一般由2、4、8、16或更多细胞组成的群体，单个的较少见。每个细胞内含有均匀的或作不规则的小颗粒体。假空泡或有或无。每个细胞外都被有质地均匀，具有层理的个体衣鞘，借此与群体中的各细胞相互分开；群体的胶质衣鞘较厚，均匀或有层理，坚固或因含多量水分而柔弱透明。在群体中两细胞的相贴靠处大多平直呈现棱角，因此细胞往往呈半球形。
⑵平裂藻属：藻体的细胞排列十分整齐，通常两个细胞两两成对，两对一组，4个组成一小群，集许多小群而成一平板状群体。 群体扁平、整齐，由一层细胞组成，当群体中的细胞不断增加而不断裂时，其群体可因扩展而弯曲，甚至作扭曲状。群体中细胞数，颇不一致，有32、64以至数百、上千个。
⑶微囊藻属：群体呈球形团块状或不规则形成穿孔的网状团块。公共胶被均匀无色。细胞球形或长圆形，互相贴靠，一般不易见到两两成对的情况。细胞内含物在浮游种类中，常有无数颗粒状泡沫形的假空泡。微囊藻多生长在湖泊、池塘等有机质丰富的水体中，营浮游生活。 PH值以8-9.5为宜。温暖季节水温在28~32℃时繁殖快，生长旺盛，使水体呈灰绿色，形成水华，肉眼可见，其浮膜似铜绿色油漆，有臭味。通常把微囊藻水华统称为“湖靛”。
⑷螺旋藻：细胞圆筒形，由单细胞或细胞间隔不明显的多数细胞所组成的螺旋状体。丝状体外无胶质衣鞘。细胞内含物匀一或有颗粒体。藻体淡蓝绿色。无段殖体。可大量繁殖形成水华。分布于淡水、海水。螺旋藻含蛋白质高达53~72%。是人类迄今发现的蛋白质含量最高的生物。
⑸颤藻： 植物体单列，不分枝。丝状体单生或结成团。细胞圆柱形、盘形。丝状体无衣鞘。细胞内含物匀一或有颗瓦有时有假空泡。丝状体顶端宜或稍弯曲，顶端细胞圆或棺状。丝状体中常产生若于透明的凹面体，丝状体由此断裂成获殖段，由藻殖段发展成新的丝状体。丝状体具有特殊运动能九能作颤动、滚动或滑动式运动。藻体通常青蓝色，各种水体中均有，种类甚多。
⑹鞘丝藻： 植物体为不分枝的单列丝状体，或聚集成或厚或薄的团块，以基部着生。丝状体呈螺旋形弯曲，或弯曲成弧形而以中间部分着生在他物上，少数以整个丝状体着生。有的营漂浮生活。胶质鞘坚固，无色、黄色至褐色或红色，分层或不分层。丝状体直或有规则螺旋形缠绕。细胞内含物均匀，或具假空泡和颗粒，亮绿色或灰绿色。海水、淡水、半咸水中皆有分布。海生种类是紫菜养殖上的主要害藻之一。
⑺束毛藻：海产，植物体为不分枝丝状体。由藻丝组成平行或放射的束状群体。无胶质鞘，亦无异形胞和厚壁孢子。藻丝末端细胞钝圆或截断形。可形成赤潮。红海束毛藻群体呈灰色，棕色或淡黄色，大小一般为3×(0.2~0.3) mm。细胞短筒形互相重叠形成藻丝，长约1~2mm，藻丝粗细上下不同，有明显的极性，上部顶端呈半球形，基部1~3个细胞通常向下逐渐细长。许多藻丝成束或成片并列丛生为群体。我国南海、渤海有分布。红海的颜色就是该藻大量发生引起的。
⑼拟鱼腥藻属：丝状体单一，螺旋形弯曲或环形弯曲，直形较少。无明显衣鞘。异形胞端生(仅具一个极节球)罕有间生。在藻丝上产生新生异形胞，是由营养细胞分裂为两个细胞所产生，它们总是成对的，暂时间位，到成熟时藻丝在两异形胞处断裂形成新生两藻丝，异形胞端位。
⑽念珠藻属：群体团块状，直径l ~3 cm。由许多类似项圈藻的藻丝交织在充满浓厚胶质的公共衣鞘中。异形胞一般间位。此藻经常生长在阴湿地和淡水中。常见种有普通念珠藻（地木耳）、发状念珠藻（发菜）和球状念珠藻（葛仙米）。
⑾束丝藻属：藻丝直或稍弯曲。单一或藻丝侧面相连成束状群体。藻丝中部细胞短柱形，多少呈方形。具假空泡。末端细胞多少变得尖细，延长成无色细胞。胶鞘模糊不清。异形胞间生，各种形状，圆柱形、近球形、椭圆形。厚壁孢子圆柱形，或宽椭圆形，原离异形胞。营浮游生活。可大量繁殖，形成水华，有的种类有毒。
生态分布的意义
蓝藻类分布很广，淡水、海水，从高温温泉到冰雪上均可生存，但在温暖和有机物含量较高的水体中较多。
蓝藻一般喜高温好强光，喜高pH和静水，喜低氮高磷，静水易孳生。
主要在淡水中生长，成为淡水中重要的浮游植物，在温暖的季节里常大量繁殖形成“水华”。在我国南方几乎一年四季都可以见到由蓝藻形成的“水华”。
在水体的垂直分布一般表层大于低层，有假空泡的更是如此。水平分布下风位多于上风位。
微囊藻水华极为常见，它是水体富营养化的标志，蓝藻水华发生时，散发腥臭味，夜间大量消耗水中溶解氧，死亡后产生羟氨或硫化氢，对水生动物有毒，破坏生态平衡，危害渔业，也使水的其他利用价值降低。在海洋沿岸带可形成束毛藻等蓝藻赤潮。
有的蓝藻可食用，螺旋藻营养丰富，含有18种人体所需的氨基酸，以及维生素和微量元素。
